漏水で苦労されているようですね。手間回数を減らす水管理の方法ですが、
除草剤処理時＝たっぷり入水・止水→除草剤散布→入水せず自然減水→田面が見え始めたら静かにたっぷり入水→７日間は湛水をキープ。
８日目からは、たっぷり入水（水口全開、稲が隠れない程度の深水）→止水→自然減水→田面露出が始まる→またたっぷり入水の繰り返し（間断かんがい）です。
藻の発生、ガスわきがない限り、中干前までは水尻は閉じたままにしておきます。